Hepariinia annettaessa oikea annos on äärimmäisen tärkeä, koska liian pienellä annoksella ei ole riittävästi antikoagulanttivaikutusta potilaan terveydentilaan, kun taas liika voi aiheuttaa verenvuotoa ja mahdollisesti johtaa kuolemaan. Oikea hepariiniannos riippuu useista tekijöistä, kuten potilaan painosta, yleisestä kunnosta ja aktiivisesta osittaisesta tromboplastiiniajasta (aPTT), joka on veren hyytymiseen kuluva aika sekunneissa. Muita painon muuttujia voidaan käyttää painon mukaan laskettavan hepariiniannoksen laskemiseen, mukaan lukien lihaville potilaille tehdyt muutokset. Lopuksi, annon aikana tilan muutokset, merkittävä verenvuoto ja muutokset hemodynaamisessa vakaudessa voivat osoittaa tarvetta muuttaa hepariiniannosta.
Koska hepariini löydettiin ensimmäisen kerran ja sitä käytettiin laajalti 20 -luvun alussa, on esitetty erilaisia mielipiteitä annoksen määrittämisestä. Lääkärit ovat keskustelleet painopohjaisen ja ei-painoperusteisen annostelun käytöstä, ja vallitseva mielipide kannattaa painopohjaista annostusta. Ei-painoon perustuva hepariiniannos osoittaa aloitusannoksen 5,000 yksikköä ja infuusioita 1,000 yksikköä tunnissa.
Nykyiset painoon perustuvat ohjeet osoittavat, että ensimmäinen bolusannos on 80 yksikköä todellisen ruumiinpainon kilogrammaa (ABW) ja ylläpitoinfuusio 18 yksikköä painokiloa kohti tunnissa, kun aPTT on alle 35 sekuntia. Säädöt tehdään aPPT: n säännöllisten arviointien perusteella, yleensä noin kuuden tunnin välein. APPT: n arviointi paljastaa, kuinka hyvin hepariini toimii kehossa. Verihiutaleiden määrä ja täydellinen verenkuva (CBC) voivat myös auttaa määrittämään, tarvitaanko hepariinin annosta.
Toista painopohjaista hepariinin annostusprotokollaa käytetään joskus laskelmien perusteella, jotka sisältävät todellisen ruumiinpainon ja vähärasvaisen painon kilogrammoina. Potilaan korkeus tuumina lasketaan. Kuusikymmentä vähennetään kokonaismäärästä. Vastaus kerrotaan 2.3: lla ja sitten 50 lisätään miehille ja 45 lisätään naisille. Vastaus vastaa potilaan laihaa painoa (LBW) kilogrammoina.
Jos ABW on yli 1.4 kertaa LBW, potilasta pidetään lihavana. Lihavan potilaan lisääntyneen veren tilavuuden huomioon ottamiseksi käytetään eri kaavaa. Tässä tapauksessa annostuspaino lasketaan ottamalla ABW: n ja LBW: n välinen ero, kertomalla tulos 0.4: llä ja lisäämällä tulos LBW: hen. Jotkut lääkärit eivät käytä tätä kaavaa toteamalla, että lihavuuden lisääntyneellä veren tilavuudella on minimaalinen vaikutus hepariiniannokseen.