On monia tekijöitä, jotka voivat vaikuttaa neurokirurgien palkkoihin, mukaan lukien kirurgin maine ja kokemus. Laitos, jossa hän työskentelee tai johon hän on sidoksissa, voi myös vaikuttaa neurokirurgin palkkaan. Kaikki hänen saamansa bonukset, kannustimet tai voitonjako -edut voivat myös vaikuttaa. Lisäksi neurokirurgien palkat vaihtelevat usein sen maan ja alueen mukaan, jossa henkilö työskentelee.
Yksi tärkeimmistä tekijöistä, jotka voivat vaikuttaa neurokirurgin palkkaan, on hänen kokemuksensa. Kun neurokirurgi on vasta aloittamassa tällä alalla, hänellä on vähemmän kokemusta kuin lääketieteen veteraanilla. Siten hänellä on usein pienempi alkupalkka. Ajan myötä hän voi kuitenkin saada kokemusta ja kehittää taitojaan samalla palkka -alueella, jolla kokeneemmat kirurgit nauttivat. Itse asiassa hänellä voi jopa olla mahdollisuus ansaita enemmän kuin he jonain päivänä.
Maine voi myös vaikuttaa rooliin määrittäessään rahan määrän, jonka neurokirurgi ansaitsee. Jotkut kirurgit, kun he ovat saaneet vuosien kokemuksen ja auttaneet lukuisia potilaita, saavat maineensa alansa parhaiden joukossa. Tämän seurauksena monet näistä lääkäreistä ansaitsevat korkeammat palkat kuin ne, joilla ei ole niin suurta mainetta. Se tosiasia, että lääkäri ei ole niin tunnettu alallaan, ei kuitenkaan aina tarkoita, etteikö hän olisi hyvä neurokirurgi; se tarkoittaa joskus, että hän ei vain ole saanut niin paljon tunnustusta lääketieteen alalla kuin muut lääkärit.
Monissa tapauksissa eri tilat tarjoavat erilaisia neurokirurgien palkoja. Yksi laitos voi esimerkiksi maksaa kirurgilleen paljon enemmän kuin toinen. Jopa yhdessä laitoksessa palkat voivat vaihdella lääkärin kokemuksen mukaan. Lisäksi yksityishenkilöiden palkat poikkeavat yleensä työnantajan palkasta.
Joidenkin neurokirurgien palkkoja nostavat muunlaiset maksut. Jotkut voivat esimerkiksi ansaita provisioita tai saada kannustimia, jotka nostavat vuosittain ansaitsemansa rahan kokonaismäärää. Bonusmaksut voivat myös vaikuttaa. Jotkut neurokirurgit nauttivat myös sellaisista eduista kuin voitonjako. Usein kirurgin hyödyt lisääntyvät hänen kokemuksensa perusteella.
Mielenkiintoista on, että maantieteellinen sijainti, jossa neurokirurgi työskentelee, voi myös vaikuttaa hänen palkkaansa. Joidenkin maiden kirurgit ansaitsevat enemmän rahaa kuin muissa maissa. Itse asiassa huomattavia palkkaeroja voi esiintyä myös saman maan alueilla.