Prostaglandiinituotantoon vaikuttavat monet tekijät, mukaan lukien kehon luonnolliset prosessit, ruokavalio ja lääkkeet. Elimistö tuottaa prostaglandiineja vasteena kudos- tai verisuonivaurioille. Erilaisten ravintorasvojen nauttiminen stimuloi kehoa tuottamaan prostaglandiineja, joista osa on hyödyllisiä ja osa mahdollisesti haitallisia. Lopuksi prostaglandiinien tuotantoa voidaan hallita ei-steroidisilla tulehduskipulääkkeillä (NSAID), kuten aspiriinilla.
Elimistön tuottama rasvahappojohdannainen prostaglandiini vaikuttaa lähes kaikkiin kehon elimiin. Jotkut prostaglandiinit aiheuttavat tulehdusta, kuumetta ja kipua sairauden tai vamman vuoksi, kun taas toiset estävät tulehdusreaktiota. Prostaglandiinit aiheuttavat myös kohdun supistuksia raskauden aikana. Ne toimivat tavalla, joka on samanlainen kuin hormonit, koska ne aiheuttavat muutoksia kehon prosesseissa, mutta ne tuotetaan kehon soluissa alueella, jolla niiden toimintaa tarvitaan.
Aspiriini ja muut tulehduskipulääkkeet vähentävät prostaglandiinituotantoa ja vähentävät kipua ja tulehdusta, mutta ne myös estävät hyödyllisten prostaglandiinien tuotantoa. Toinen lääkeryhmä, jota kutsutaan selektiivisiksi COX-2-estäjiksi, vähentää vain tulehdusta edistävää prostaglandiinituotantoa ja jättää hyödylliset prostaglandiinit yksin.
Prostaglandiinien tuotannolla on tärkeä rooli synnytykseen johtavien kohdun supistusten aiheuttamisessa. Synnytyksen aikaansaamiseksi prostaglandiineja voidaan levittää kohdunkaulaan tai ottaa suun kautta. Mielenkiintoista on, että siemenneste sisältää myös prostaglandiineja, mikä johtaa tieteellisesti kumottuun teoriaan, jonka mukaan yhdyntä stimuloi työtä.
Koska prostaglandiinit johdetaan ja syntetisoidaan rasvahapoista, ruokavaliota voidaan käyttää joko estämään kipua ja tulehdusta aiheuttavia antagonistisia prostaglandiineja tai stimuloimaan hyödyllistä prostaglandiinituotantoa tulehduksen vähentämiseksi. Elintarvikkeet, joissa on paljon tyydyttynyttä eläinrasvaa, kuten punainen liha ja meijeri, sisältävät arakidonihappoa (AA). Tämä rasvahappo on antagonisti -prostaglandiinituotannon edeltäjä, joka tuottaa tulehdusta kehossa, mukaan lukien prostaglandiinityyppi, joka lisää kohdun supistuksia.
Kasviöljyjä ja B-vitamiineja sisältävät elintarvikkeet, kuten pähkinät ja siemenet, sisältävät linolihappoa (LA), joka muuttuu elimistössä gamma-linolihapoksi (GLA). LA ja GLA stimuloivat tulehdusta estävää prostaglandiinituotantoa. Kalaöljyt, jotka sisältävät eikosapentaeenihappoa (EPA), helokkiöljyä ja purasruohoöljyä, sisältävät myös suuria määriä GLA: ta.
Muut aineet voivat lisätä prostaglandiinien hyödyllistä tuotantoa ja samalla tukahduttaa tulehduksellisia prostaglandiineja. Bromelain on entsymaattinen aine, joka on johdettu ananaksista ja jota on käytetty historiallisesti tulehduksellisten tilojen hoitoon. Vaikka tulokset ovat olleet ristiriitaisia, jotkut tutkimukset osoittavat, että se estää tulehduksellisia prostaglandiineja, jotka syntyvät nivelrikon, ruoansulatushäiriöiden ja poskiontelotulehduksen seurauksena. Kurkuma, mangosteen ja granaattiomena ovat myös osoittaneet prostaglandiineja tukahduttavia ominaisuuksia, ja niitä tulisi tutkia tarkemmin niiden vaikutusten vuoksi prostaglandiinituotantoon.