Mikroaaltouunipopcornin käyttöönotto 1980-luvulla vaikutti luonnolliselta edistymiseltä liesi-popcornin ja ilma-pop-popcornin menestyksen jälkeen. Kuluttaja laittaa taitetun pussin, joka sisältää öljyä, makuaineita ja popcornin ytimiä mikroaaltouuniin muutamaksi minuutiksi. Tulokset voivat olla vaihtelevia, puoliksi popped-pussista tupakointipussiin hiiltä, mutta yleensä mikroaaltouuni-popcorn oli samanlainen kuin muut popcorn-muodot ja tehtiin paljon lyhyemmässä ajassa.
Mikroaaltouunipopcornin turvallisuutta koskevia kysymyksiä alkoi ilmaantua, kun joukko popcornitehtaan työntekijöitä alkoi ilmoittaa vakavista hengitysvaikeuksista työskennellessään popcornin käsittelyyn käytettävien kemikaalien kanssa. Erityisesti diasetyylinä tunnettu kemikaali epäiltiin ärsyttäväksi. Diasetyyliä käytetään luomaan voin maun erilaisissa mausteissa ja jalostetuissa elintarvikkeissa, mukaan lukien keinotekoinen voin maku, jota käytetään mikroaaltouuni -popcornissa. Pieniä määriä diasetyyliä ei pidetä myrkyllisenä, mutta tehdasasteikolla lämmitettäessä höyryt voivat laukaista popcorn -keuhkoksi kutsutun hengityselinten sairauden.
Kun sana popcornityöntekijöiden altistumisesta diasetyylille tuli julkiseksi, monet terveydenhuollon ammattilaiset olivat huolissaan mikroaaltouunipopcornin turvallisuudesta kuluttajatasolla. FDA ja muut virastot päättivät, että keskimääräisen pussin sisältämä diasetyylimäärä ei saavuttanut myrkyllisiä tasoja, vaikka kriitikot kyseenalaistivat näiden havaintojen paikkansapitävyyden, kun he havaitsivat, että kuluttajatasolla oli tehty vain vähän tai ei lainkaan testejä. Lähes kaikki ilmoitetut popcorn -keuhkotapaukset tapahtuivat popcornitehtaan työntekijöillä, mutta yksi kuluttaja, joka söi kaksi pussia popcornia päivittäin ja haisti tavallisesti savun, sairastui lievempään tautitapaan.
Jos mikroaaltouunipopcorniin liittyy vaaraa, sitä esiintyy eniten, kun pussi avataan ensimmäisen kerran ja lämmitetyt höyryt poistuvat. Näiden höyryjen hengittäminen altistaa kuluttajan korkeimmalle mahdolliselle diasetyylitasolle kuluttajatasolla. Tämä voi vahingoittaa pienimpiä ilmakanavia kuluttajan keuhkoissa tai laukaista jo olemassa olevan astmakohtauksen. Pienillä lapsilla ja niillä, joilla on heikentynyt keuhkojen kapasiteetti, voi myös esiintyä haittavaikutuksia, kun ne ovat hengittäneet mikroaaltouunipopcornin kuuman pussin ensimmäiset savut.
Muita mikroaaltouunipopcornin sisältämiä ainesosia ei pidetä myrkyllisinä, vaikka jotkut terveydenhuollon asiantuntijat varoittavat korkeiden natrium- tai osittain hydrattujen öljyjen kulutuksesta. Se käyttää yleensä terveellisempiä öljyjä, joita tietyt elokuvatyyppiset popcornit tarjoillaan teattereissa tai käyttöoikeustiloissa. Keinotekoisen voin tai ylimääräisen suolan lisäämisen välttäminen on aina hyvä idea terveellisemmäksi välipalaksi.