Seksuaalisesti tarttuvien tautien leviämisen ja veren välittämien infektioiden leviämisen estämiseksi on yleensä turvallista harrastaa seksiä kuukautisten aikana. Seksin harrastaminen kuukautisten aikana ei vahingoita kuukautisia naista tai hänen kumppaniaan. Tämä ei kuitenkaan tarkoita sitä, että kuukautisten aikana harrastanut nainen ei voi tulla raskaaksi. On mahdollista, että kuukautisten aikana hänen kehoonsa tulevat siittiöt voivat säilyä riittävän kauan hedelmöittääkseen myöhemmin vapautuvan munasolun. Näistä syistä, jos sukupuolitautien (STD) riski tai raskaus on huolenaihe, pari voi olla viisasta käyttää kondomia tällä hetkellä tai pidättäytyä yhdynnästä.
Yleensä seksi on turvallista kuukautisten aikana. Mikään kuukautisten aikana tapahtuvista fyysisistä prosesseista ei ole vaarallinen kuukautiskierron naiselle tai hänen seksikumppanilleen. Itse asiassa monet naiset pitävät seksiä kuukautisten aikana helpottavana joitakin epämiellyttävimpiä oireita, jotka usein liittyvät kuukautisiin. Esimerkiksi nainen voi huomata, että se auttaa lievittämään kouristuksia ja jännitystä. Jotkut naiset jopa väittävät, että seksi auttaa lievittämään kuukautisiin liittyvää päänsärkyä ja ärtyneisyyttä.
Monet naiset huomaavat myös, että miellyttävät tunteet lisääntyvät, kun he harrastavat seksiä kuukautisten aikana. Esimerkiksi jotkut naiset ovat hermostuneempia kuukautisten aikana, ja toisten on helpompi saada orgasmeja tänä aikana. Tämä voi johtua ainakin osittain siitä, että kuukautiset liittyvät lisääntyneeseen täyteyden tunteeseen naisen sukuelinten alueella.
Se, kuinka turvallinen seksi on kuukautisten aikana, voi riippua siitä, käyttääkö pariskunta suojaa vai ei, vai onko varma, että molemmat osapuolet ovat vapaita sukupuolitaudeista. Kuukautisten aikana naisen kohdunkaula avautuu, jotta kuukautiskierron veri pääsee läpi, mikä tarkoittaa, että nainen voi olla jopa alttiimpi sukupuolitaudeille kuin muina syklin aikoina. Kuukautisia tekevä nainen voi myös siirtää todennäköisemmin veren välittämiä infektioita seksikumppanilleen tänä aikana. Jopa hiiva -infektiot voivat tarttua todennäköisemmin kuukautisten aikana emättimen pH -arvon muutosten vuoksi. Jotta sukupuoli pysyisi turvassa kuukautisten aikana, ihmisiä, jotka eivät ole varmoja olevansa yksiavioisissa suhteissa, kehotetaan yleensä käyttämään kondomeja.
Keskustelut turvallisesta seksistä kuukautisten aikana sisältävät usein raskauden. Joillekin ihmisille saattaa jäädä sellainen vaikutelma, että heidän ei tarvitse huolehtia raskaudesta kuukautisten aikana. Totuus on kuitenkin se, että kuukautisten aikana kehoon saapuva siittiö voi selviytyä riittävän kauan naisen kyllästämiseksi. Vaikka se ei ole todennäköistä, on jopa mahdollista, että muna vapautuu, kun naisella on edelleen verenvuotoa emättimestä.