Klindamysiini on antibiootti, jota pidetään yleisesti turvallisena raskauden aikana, varsinkin kun otetaan huomioon, että jotkut hoitamattomat infektiot voivat johtaa ennenaikaiseen synnytykseen. Lääkärit määräävät useimmiten klindamysiiniä raskauden aikana bakteerivaginoosin ja kohdun tai sikiön kudoksen infektioiden uhan poistamiseksi. Yhdysvaltain elintarvike- ja lääkevirasto (FDA) sijoitti tämän lääkkeen raskausluokkaan B, koska tutkimukset eivät osoita haitallisia vaikutuksia eläinten sikiöihin. Toisaalta tiedetään, että tämä lääke läpäisee istukan, ja koska ihmisillä tehdyt tutkimukset eivät riitä varmistamaan sen turvallisuutta, sitä tulisi käyttää vain, jos lääkäri uskoo, että sen hyödyt ovat suuremmat kuin naiselle ja sikiölle aiheutuvat riskit.
Bakteerivaginoosi on yleinen infektio, jota tulisi tyypillisesti hoitaa raskauden aikana, koska se voi vahingoittaa sikiötä. Suurimpia riskejä ovat ennenaikaisen synnytyksen todennäköisyyden lisääntyminen ja alhainen syntymäpaino. Vaikka klindamysiinin käyttö voi hoitaa infektiota, tämä tila on usein oireeton, joten naiset, jotka ovat alttiita ennenaikaiselle synnytykselle, voidaan testata tämän oireiden puutteesta huolimatta. Tämä osoittaa, kuinka vaarallista se voi olla, jos sitä ei käsitellä, ja miksi klindamysiini raskauden aikana on usein tarpeen, kun bakteerivaginoosi diagnosoidaan.
Tätä lääkettä käytetään myös joskus sikiön kudoksen tai kohdun infektioiden hoitoon, koska se voi läpäistä istukan. Toisaalta lääkärit voivat odottaa, kunnes vauva syntyy, hoitamaan tiettyjä äidin infektioita, kunhan ne ovat vähäisiä eivätkä aiheuta vaaraa äidille tai lapselle. Esimerkiksi lääkärit eivät todennäköisesti käytä klindamysiiniä raskauden aikana aknen hoitoon, koska tämän tilan riskit eivät tyypillisesti ole suuremmat kuin useimpien lääkkeiden riskit raskauden aikana. Sen sijaan he voivat odottaa, kunnes vauva syntyy, tai valita antibiootin, joka on tutkittu asianmukaisesti ihmisillä.
Vaikka eläinkokeet eivät osoita lisääntynyttä synnynnäisten vikojen riskiä klindamysiinin käytön aikana raskauden aikana, minkä vuoksi se kuuluu raskausluokkaan B, sitä on silti käytettävä varoen. Tämä johtuu siitä, että ihmisillä tehtyjä tutkimuksia ei kontrolloitu riittävästi tarkan vaikutuksen määrittämiseksi ihmisen sikiöön. Turvallisuuden vuoksi monet lääkärit määräävät tämän lääkityksen vain toisen kolmanneksen aikana, mikä voi vähentää keskenmenon tai synnynnäisten vikojen riskiä. Lisäksi on huomattava, että tämä lääkitys näkyy pieninä määrinä äidinmaidossa, joten imettävää äitiä kehotetaan odottamaan useita tunteja ennen imetystä, jos heidän on otettava tämä lääke.