On vaikea määrittää, onko jokin lääkitys 100-prosenttisesti turvallinen käytettäväksi raskauden aikana, eikä kodeiini ole poikkeus. Kodeiinin käyttöä raskauden aikana koskevat tutkimukset eivät ole poissulje vauvojen kehittymisen riskiä. Yleensä lääkärit välttävät lääkkeen määräämistä, elleivät he päätä, että lääkityksen käytön hyödyt ovat suurempia kuin mahdolliset riskit, jotka nainen hyväksyy sen käytön aikana. Suurin näistä riskeistä voi olla kasvun hidastuminen ja sikiön riippuvuus lääkkeestä. On myös mahdollista, että sikiö kärsii vieroitusoireista, kun hänen äitinsä lopettaa lääkityksen.
Yleensä lääkärit ovat haluttomia määräämään lääkkeitä yleensä raskauden aikana. Tämä johtuu siitä, että on vaikea tietää, aiheuttaako lievä lääkitys synnynnäisen vian tai vaikuttaako se muutoin sikiöön haitallisesti. Lääkärit määräävät kuitenkin kodeiinia raskauden aikana, kun he päättävät, että odottavan äidin hyöty on suurempi kuin sikiölle aiheutuvat riskit. Esimerkiksi, jos nainen kärsii kohtalaisesta vaikeaan kipuun, lääkäri voi määrätä kodeiinia sen lievittämiseksi. Joissakin tapauksissa lääkärit määräävät myös kodeiinia yskän estämiseksi.
Kodeiinin turvallisuus raskauden aikana on epävarmaa, koska ei ole tehty tarpeeksi kontrolloituja tutkimuksia sen määrittämiseksi, onko se vakava riski kehittyvälle vauvalle vai ei. Tärkein riskipotentiaali kodeiinin käytölle raskauden aikana näyttää olevan riippuvuus. Kodeiini voi aiheuttaa riippuvuutta paitsi odottavalle äidille myös hänen kehittyvälle lapselleen. Lisäksi on huolestuttavaa, että kodeiinin käyttö raskauden aikana voi johtaa sikiön kasvun hidastumiseen. Itse asiassa kodeiinin käyttö voi jopa aiheuttaa sikiölle vieroitusoireita, kun odottava äiti lopettaa sen ottamisen.
Jos lääkäri toteaa, että odottavan äidin hoidontarve on suurempi kuin kodeiinin ottamisen riski raskauden aikana, hän voi määrätä hänelle lääkityksen huolellisesti annostuksesta. Useimmissa tapauksissa hän määrää pienimmän annoksen, joka lievittää tuskaa tai tukahduttaa yskää; pienempi annos voi auttaa minimoimaan vauvan riskin. Hän voi myös suositella, että hän lopettaa lääkityksen käytön heti, kun hänen oireensa ovat vähentyneet tai ne ovat kestävämpiä. Kun odottava äiti synnyttää, kodeiinin käyttö voi olla vähemmän huolestuttavaa. Vaikka lääke voi kulkeutua rintamaidon läpi, kodeiinin käyttö imetyksen aikana ei liity suureen riskiin.