Tuhansien muiden juutalaisten perheiden ohella frankit lähtivät natsi-Saksasta 1930-luvun alussa kasvavan antisemitismin keskellä ja lopulta saivat uuden kodin Amsterdamissa. Otto Frank ja hänen vaimonsa Edith sekä tyttärensä Margot ja Anne jatkoivat normaalia elämää siellä vuoteen 1940 asti, jolloin Saksa hyökkäsi Alankomaihin. Kun Margot sai Gestapon käskyn ilmoittautua työleirille heinäkuussa 1942, perhe piiloutui neljän muun kanssa. He pysyivät piilossa kaksi vuotta, kunnes löydettiin elokuussa 1944. Maailma sai myöhemmin tietää heidän salaisesta elämästään, kun hänen isänsä julkaisi Anne Frankin päiväkirjan vuonna 1947, joka oli ainoa perheenjäsen, joka selviytyi holokaustista. Kaiken kaikkiaan Annen vanhempi sisar Margot oli myös lahjakas kirjailija ja syvä ajattelija. Margotin tiedettiin pitäneen omaa päiväkirjaansa frankien piilovuosien aikana, mutta sitä ei ole koskaan löydetty.
Salaisen liitteen jälkeen:
Nuoren tytön päiväkirjasta tuli yksi historian tunnetuimmista juutalaisten kokemuksista toisen maailmansodan ja holokaustin aikana, ja se käännettiin 70 kielelle. Anne mainitsee kirjassa Margotin päiväkirjan.
Löytönsä jälkeen Frank -perhe pidätettiin ja vietiin Westerborkin kauttakulkuleirille ja sitten Auschwitziin, missä Edith Frank kuoli nälkään. Margot ja Anne siirrettiin Bergen-Belseniin Pohjois-Saksaan.
Margotin (19) ja Anne (15) uskotaan sairastaneen lavantautiin Bergen-Belsenissä ja kuolleen siellä helmikuussa tai maaliskuussa 1945-vain viikkoja ennen Ison-Britannian armeijan vapauttamista.