Puhtaassa muodossaan kvinoassa ei ole gluteenia. Kvinoa -tuotteissa voi kuitenkin olla gluteenia. Ihmisillä, joilla on tai ei ole gluteeniherkkyyttä, voi silti olla negatiivisia reaktioita siemeniin, mikä voi riippua siitä, miten se on valmistettu. Silti monille ihmisille perinteisten gluteenipitoisten elintarvikkeiden korvaaminen quinoalla on hyvä vaihtoehto, varsinkin jos tämä korvaaminen tapahtuu hallittavalla tahdilla.
Osittain siksi, että kvinoassa ei ole gluteenia, sitä on käytetty useissa elintarvikkeissa ihmisille, joilla on gluteeniallergia tai herkkyys. Kuluttajien on noudatettava varovaisuutta ostaessaan näitä tuotteita, koska markkinoilla on nyt lukuisia elintarvikkeita, jotka sisältävät siemeniä, mutta eivät ole gluteenittomia. Ihmisten tulisi tarkastaa pakkaukset määrittääkseen, onko tuote merkitty gluteenittomaksi. Äärimmäisten allergioiden tulisi myös lukea tuotteiden valmistuksesta varmistaakseen, että yritykset eivät käytä laitteita, jotka joutuvat kosketuksiin gluteenin kanssa.
Jopa perusteellisen tarkistuksen jälkeen varmistaakseen, ettei se ole saastunut gluteenilla, jotkut ihmiset voivat silti reagoida quinoaan. Raportteja haittavaikutuksista ovat ihottuma, äärimmäiset vatsavaivat ja pyörtymisen tunne. Vatsavaivoja voi esiintyä satunnaisesti, jos ihmiset eivät valmistele siementä oikein. Se on peitetty katkeralla pinnoitteella, joka on pestävä perusteellisesti ennen ruoanlaittoa. Jos tätä päällystettä jää liikaa, ihmisille voi kehittyä vatsavaivoja, vaikka kvinoassa ei ole gluteenia.
Monet ihmiset ovat jo tietoisia näistä mahdollisista sudenkuopista ja ostavat sen kanssa esipestyä quinoaa tai gluteenittomia ruokia. Jotkut saattavat edelleen huomata, että he reagoivat negatiivisesti quinoaan. Se tuskin on tietyllä tavalla yllättävää, koska useimmat elintarvikkeet aiheuttavat epämiellyttäviä sivuvaikutuksia joillekin ihmisille. Koska siemen on äskettäin johdettu moniin länsimaisiin ruokavalioihin, on liian aikaista sanoa, kuinka usein nämä reaktiot tapahtuvat ja kuinka suuri osa väestöstä saattaa vaikuttaa. Haittavaikutukset eivät todellakaan rajoitu ihmisiin, joilla on gluteeni -intoleranssi, ja niitä on esiintynyt useilla henkilöillä, jotka eivät ilmoita aikaisemmista ruoka -aineallergioista.
Koska kvinoassa ei ole gluteenia, sen erittäin kuitumaisen luonteen vuoksi toinen selitys vatsavaivoille syömisen jälkeen on mahdollista. Jos ihmiset yhtäkkiä siirtyvät tahmeammista jyvistä kvinoaan, he saattavat kuluttaa tavallista enemmän kuitua. Tämä voi joskus aiheuttaa ruoansulatuskanavan toiminnan hyvin nopeasti.
Nopeat muutokset ruokavaliossa voivat aiheuttaa turvotusta, kaasua ja ripulia, jotka voidaan tulkita väärin gluteeniherkkyydeksi tai allergiaksi. Tämän reaktion välttämiseksi ihmisten tulisi aloittaa ravintokuitujen nauttiminen hitaasti, lisäämällä kuituruokaa vähitellen, kun heidän kehonsa lisää suvaitsevaisuutta. Keskimääräinen vähäkuituinen syöjä, joka ei voi vastustaa pinoa quinoa -muffinsseja, voi katua tätä valintaa jälkikäteen.