Laparoskooppinen leikkaus on yleisin toimenpide endometrioosin diagnosoimiseksi ja kohdun limakalvon kystien poistamiseksi – ei -syöpämassoiksi, jotka sisältävät kohdun limakalvon kudoksia. Potilaasta ja hänen endometrioosin vakavuudesta riippuen laparoskooppinen leikkaus voi olla erittäin tehokas hoito. Leikkaus on minimaalisesti invasiivinen ja suoritetaan yleensä avohoidossa. Potilaat kokevat usein välittömän helpotuksen kivusta, ja monissa tapauksissa lisääntynyt hedelmällisyys on mahdollista. Leikkauksen tulokset voivat olla pysyviä, mutta monet naiset kokevat toistumisia ja vaativat lisähoitoa.
Endometrioosin laparoskooppisen leikkauksen aikana tehdään pieni viilto merivoimien pohjaan. Vatsa on täynnä kaasua – yleensä hiilidioksidia -, joka täyttää vatsan, jolloin lääkäri näkee helpommin, kun hän on asettanut laparoskoopin, pienen, valaistun laitteen, jossa on kamera, jonka avulla kirurgi voi tutkia potilaan kohtua ja munasarjoja ilman tekee avointa leikkausta. Usein laparoskooppinen leikkaus tehdään endometrioosin diagnosoimiseksi. Jos endometriooma löytyy, se voidaan poistaa. Tätä varten kirurgi tekee yhden tai useamman lisäviillon vatsaan, jonka kautta hän voi asettaa kirurgiset instrumenttinsa.
Gynekologi voi suositella laparoskooppista leikkausta endometrioosiin, jos potilaalla on kuukautiskiertoon, hedelmättömyyteen tai muihin endometrioosin oireisiin liittyvää epänormaalia kipua. Endometrioosin laparoskooppisen leikkauksen etuna on, että se on suhteellisen lyhyt toimenpide, joka kestää yleensä 30–45 minuuttia. Se voidaan tehdä avohoidossa, ja toipumisaika leikkauksen jälkeen on tyypillisesti vain muutamasta päivästä viikkoon. Naisille, jotka kokevat vatsakipua, laparoskooppinen leikkaus voi tarjota välittömän kivun lievityksen monissa tapauksissa, kun taas vaihtoehtoinen hoito, kuten hormonihoito, ei ehkä.
Naisille, jotka etsivät helpotusta endometrioosiin liittyvästä kivusta, laparoskooppinen leikkaus on tehokas 70-100%: lla naisista ensimmäisinä kuukausina leikkauksen jälkeen. 45%: lla naisista oireet toistuvat ensimmäisenä vuonna leikkauksen jälkeen. Mitä kehittyneempi endometrioosi on, sitä todennäköisemmin nainen kokee endometrioosin tai kohdun limakalvon uusiutumisen. Endometrioosin laparoskooppisen leikkauksen aikana kirurgi voi joko tyhjentää tai leikata osan endometrioomasta tai poistaa kokonaan kohdun limakalvon. Monet lääkärit suosittelevat täydellistä poistoa tehokkaimpana keinona lievittää kohdun limakalvon kipua ja estää endometrioosin uusiutumista.
Naisilla, joiden hedelmättömyys liittyy endometrioosiin, on erilaisia tuloksia endometrioosin laparoskooppisen leikkauksen jälkeen. Laparoskopia näyttää olevan vähemmän tehokas lievissä endometrioositapauksissa. Kohtalaisista ja raskaista tapauksista endometrioosin laparoskooppinen leikkaus voi kuitenkin olla hyödyllinen ja voi johtaa hedelmällisyyden lisääntymiseen. Muita tekijöitä, jotka määrittävät voimakkaasti naisen hedelmällisyyden endometrioosin laparoskooppisen leikkauksen jälkeen, ovat hänen ikä, munien elinkelpoisuus ja keskenmenon riski.