Proteiinit koostuvat rakennuspalikoista, joita kutsutaan aminohapoiksi. Kun kaksi tai useampia aminohappoja tarttuu yhteen ketjussa, niitä voidaan kutsua polypeptideiksi. Jokainen aminohappojen välinen linkki, jossa energian vetovoima pitää lohkot yhdessä, on peptidisidos. Polypeptidit suorittavat monia toimintoja kehossa.
Aminohapot ovat pieniä molekyylejä, jotka ovat olennaisia rakennuspalikoita biologiassa. Monet biologiset toiminnot perustuvat proteiinin tai polypeptidin toimintaan. Yleensä hyvin lyhyitä polypeptidejä kutsutaan yleensä peptideiksi, ja erittäin pitkiä, joissa on yli 100 aminohappoa, kutsutaan proteiineiksi. Kaikki proteiinit kuuluvat polypeptidiryhmään, mutta jotkut polypeptidit eivät täytä proteiinin kriteerejä.
Nimen peptidiosa on peräisin kahden aminohapon rakennuspalikan välisen sidoksen tyypistä. Jokaisella aminohapolla on toinen pää, jota kutsutaan alfa-karboksyyliryhmäksi, ja toinen pää, jota kutsutaan alfa-aminoryhmäksi. Näillä kahdella ryhmällä on erilaiset kemialliset ominaisuudet.
Alfa-karboksyylillä on taipumus sitoutua alfa-aminoon ja päinvastoin. Siksi yksittäisellä aminohapolla on taipumus kiinnittyä toiseen aminohappoon tietyllä tavalla, kuten yksi henkilö, joka pitää käsiään toisen henkilön kanssa. Toinen käyttää oikeaa kättä ja toinen vasenta kättään sidoksen loppuunsaattamiseen. Tämä sidoksen muoto on peptidisidos, ja kun nämä kaksi molekyyliä tarttuvat yhteen, ne tuottavat yhden molekyylin.
Kahden aminohapon liittäminen yhteen vaatii energiaa. Keho tuottaa tämän energian, kun sen on tehtävä uusia polypeptidejä biologiseen käyttöön. Kahden aminohapon liimaamisen jälkeen sidos on melko vakaa eikä hajoa helposti.
Polypeptidit sisältävät monia näistä aminohapoista kiinni toisiinsa suorassa linjassa samalla tavalla kuin ihmisten joukko, jotka pitävät käsiään niiden välissä. Tyypillisesti polypeptidiketjussa on myös ketjuja, jotka tarttuvat sivulle tietyissä kohdissa. Yksi polypeptidi voi sisältää jopa 2,000 yksittäistä aminohappoa.
Elimistössä polypeptidit voivat suorittaa toimintoja sellaisina kuin ne ovat. He voivat myös joutua liittymään toiseen muodostamaan uuden proteiinin, jolla on biologinen tehtävä. Joskus yksittäinen polypeptidi luodaan suurena solutuotteena, ja sitten solu pilkkoo sen entsyyminä toiminnallisiksi osiksi.
Polypeptidit valmistetaan ensin, kun solu lukee geneettiset ohjeet ja muuntaa nämä tiedot aminohapposekvenssiksi. Jokainen geeni koodaa tiettyä tuotetta, ja tarvittavat aminohapot kerätään ja kiinnitetään yhteen oikeassa järjestyksessä. Sekvenssi on välttämätön, jotta polypeptidi toimisi kunnolla, koska muuten se ei voi olla vuorovaikutuksessa kohteidensa kanssa.