Hengellinen polku Siddha -jooga perustuu olennaisesti filosofiaan, joka keskittyy sisäiseen itseen ja voi tuoda ihmisen lähemmäksi Jumalaa. Se perustuu vahvasti Kashmirin shaivismiin ja Vedanta -hindulaisiin hengellisiin perinteisiin. Sen harjoittajat esittävät Siddhajoogaa yksilöllisenä hengellisyytenä, jota kehitetään usein uskonveljien yhteisössä. Organisaation yksilöllisestä käsityksestä riippuen sitä kutsutaan tyypillisesti joko uudeksi uskonnolliseksi liikkeeksi tai kultiksi.
Siddha -jooga on yhdistelmä päivittäistä harjoittelua ja gurun antamia opetuksia. Opetukset sisältävät opetusta itsensä löytämisen perusfilosofioista, toisten palvelemisesta ja hindulaisen uskonnon raamatullisten perinteiden noudattamisesta. Harjoitus sisältää meditaatiota, laulamista ja pyhän musiikin kuuntelua. Nämä toimet suoritetaan tyypillisesti meditaatiokeskuksissa ja retriiteillä, vaikka joitain päivittäisiä toimintoja voidaan harjoitella myös kotona.
Siddhajoogassa uusi opiskelija aloitetaan yleensä hengellisesti shaktipat diksha -nimisellä harjoituksella. Tämä on prosessi, jolla guru toivottaa halukkaan oppilaan tervetulleeksi symbolisella eleellä, kuten kosketuksella, mantralla tai pyhällä sanalla. Tällä tavoin gurun uskotaan tunkeutuneen oppilaan henkeen. Jotkut menetelmän seuraajat ovat kuvailleet tätä prosessia gurun aurana, joka ympäröi opiskelijan.
Swami Muktananda Paramahamsa perusti Siddha -joogan Intiaan henkisen opettajansa Bhagawan Nityanandan johdolla. Lopulta hän avasi useita meditaatiokeskuksia ympäri maailmaa. Keskuksia on ollut Japanissa, Yhdysvalloissa, Isossa -Britanniassa, Australiassa ja Ranskassa monien muiden maiden joukossa. Liike on keskittynyt New Yorkin ja Ganeshpurin suurimpiin ashrameihin Intiassa. Swami Muktanandan kuoleman jälkeen vuonna 1982 hänen opetuslapsensa Gurumavi Chidvilasanada, joka alun perin tunnettiin nimellä Malti Shetty, otti Siddha -joogaliikkeen hengellisen johtajuuden.
Joidenkin Siddha -joogagurujen ja liikkeen toiminnasta on kiistelty. William Rodarmor vuonna 1983 ja Lis Harris 1994 esittivät epäilyjä käytännöstä useissa julkaistuissa artikkeleissa. Vuodesta 1996 lähtien verkkosivusto Leaving Siddha Yoga on myös säilyttänyt erittäin kriittisen äänen liikkeelle ja sen johtajille. Väitteitä liikettä vastaan ovat sisältäneet seksuaalinen hyväksikäyttö, mielenhallinta ja häiritsevät ja sopimattomat riidat gurujen ja heidän kumppaneidensa keskuudessa. Liikkeessä on myös ollut pääasiassa positiivisia profiileja useiden suosittujen aikakauslehtien artikkeleissa.