Helmet ovat eri värejä ja sävyjä, valkoisesta, kermanvärisestä ja vaaleanpunaisesta mustaan, sinisellä, vihreällä tai violetilla sävyllä. Monet tekijät ovat vastuussa helmen väristä, mutta se on suurimmaksi osaksi sattumaa. Mustahuulinen osteri ei yleensä luo valkoista helmeä, ja on hyvin harvinaista, että muut osterit tuottavat mustan helmen. Muuten on kuitenkin vain vähän varmuutta siitä, minkävärisiä helmiä voit odottaa korjaavan tietyiltä ostereilta tai tietyiltä alueilta.
Materiaali, joka muodostaa helmen, joka tunnetaan nimellä nacre, erittää osteri vasteena ärsyttävälle aineelle kuoren sisällä. Luonnonhelmet ovat erittäin harvinaisia ja kalliita, ja ne koostuvat samankeskisistä kerroksista helmiäiskerrosta mahdollisesti mikroskooppisen alkuperäisen ärsyttävän aineen, kuten hiekkapalan, ympärillä. Viljeltyjä helmiä valmistetaan lisäämällä kuoren ydin, joka on tyypillisesti täysin pyöreä, ja sen ympärille voi muodostua muutama kerros helmiäistä.
Helmen väriin vaikuttavia tekijöitä ovat osterityyppi, helmirakenteiden paksuus ja kerrosten määrä sekä mahdollisesti hivenaineet osterin vesiympäristössä. Helmivalmistaja voi myös vaikuttaa helmen väriin jossain määrin tuomalla kudosta toisesta osterista isäntäosteriin kuoren ytimen kanssa. Helmen väri määräytyy useiden tekijöiden yhdistelmän perusteella: perusväri, sävy ja värikkäys. Myös viljellyt helmet värjätään toisinaan.
Mitä paksumpi helmi, sitä rikkaampi on helmen väri ja sitä värikkäämpi se näkyy. Ohut nacre pyrkii muodostamaan maitomaisen näköisen helmen, jossa on vähän sävyjä. Helmen värähtely johtuu läpikuultavan helmihalkion päällekkäisistä kerroksista.
Helmi väri voi vaikuttaa tai ei vaikuta sen hintaan, vaikka värin tasaisuus tekee helmistä arvokkaampia. Mustat helmet olivat ennen melko harvinaisia ja erittäin arvokkaita, mutta niitä on nyt viljelty ja näin ollen paljon laajemmin saatavilla. Luonnonvalkoiset helmet ovat harvinaisempia ja arvokkaampia kuin viljellyt mustat helmet. Paras väri on pitkälti henkilökohtainen valinta tai mikä tahansa, joka imartelee ihon sävyä, vaikka alueelliset mieltymykset ovat olemassa ja voivat vaikuttaa hintaan.